Ausgangssituation:
Die Benutzerkonten auf einem FileZilla FTP-Server sollen exportiert werden. Der alte Server hat die Versionsnummer 0.9.40 beta. Der neue Server hat die Versionsnummer 1.6.6.

Schritte:

Vom alten Server die Datei „FileZilla Server.xml“ auf den neuen Server in z. B. „C:\temp“ kopieren.

Auf den neuen Server ein Konsolenfenster öffnen und in das Verzeichnis „C:\Program Files\FileZilla Server\“ wechseln

Dort folgenden Befehl ausführen:

filezilla-server-config-converter.exe "c:\temp\filezilla server.xml" filezilla

Aus dem Verzeichnis „C:\Users\<Benutzername>\AppData\Local\filezilla“ die Datei „users.xml“ nach „C:\ProgramData\filezilla-server“ kopieren.

Den Dienst „filezilla-server“ neu starten.

Quelle: https://forum.filezilla-project.org/viewtopic.php?t=54066